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《中國材料進(jìn)展網(wǎng)》

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法媒:計(jì)算機(jī)算力或成抗疫關(guān)鍵 制作新冠病毒3D模型

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發(fā)布時間:2020年4月29日 已經(jīng)查看了295次

參考消息網(wǎng)4月27日報(bào)道 法媒稱,計(jì)算機(jī)和超級計(jì)算機(jī)將有一個光榮的任務(wù):制作新冠病毒蛋白質(zhì)的3D模型。最初只有3萬臺計(jì)算機(jī),現(xiàn)在通過Folding@Home項(xiàng)目已經(jīng)有超過70萬臺計(jì)算機(jī)共同參與進(jìn)來。該項(xiàng)目負(fù)責(zé)人、美國生物化學(xué)家格雷格·鮑曼高興地說:“有了這一參與勁頭而且吸引了很多個人和機(jī)構(gòu)的加入,我們已經(jīng)虛擬地創(chuàng)造了世界上最強(qiáng)大的計(jì)算機(jī)。”

據(jù)法國《快報(bào)》周刊網(wǎng)站4月25日報(bào)道,真實(shí)情況肯定會略有不同。從科學(xué)角度講,通過Wi-Fi聯(lián)網(wǎng)交替進(jìn)行數(shù)百萬次小量計(jì)算,遠(yuǎn)遠(yuǎn)比不上超級計(jì)算機(jī)集中算力完成一項(xiàng)任務(wù)那么有效。另外,Folding@Home項(xiàng)目所宣布的每秒240億億次浮點(diǎn)運(yùn)算能力,可能從未被完全調(diào)動并運(yùn)用過。不過該項(xiàng)目仍能讓人們對一件事情的認(rèn)知取得進(jìn)展——蛋白質(zhì)的模型構(gòu)建,尤其是新冠病毒蛋白質(zhì)模型。

巴黎索邦大學(xué)教授讓-菲利普·皮克馬爾表示:“這方面的研究正處于爆發(fā)期。全球有數(shù)十家實(shí)驗(yàn)室在進(jìn)行。它們將病毒分離成很多部分,試圖以虛擬的形式來用模型表述。”

這么做的目的是什么呢?是為了推進(jìn)對新冠肺炎的治療。因?yàn)椋胧挂环N藥物有效,研究人員必須清楚藥物能在哪方面發(fā)揮作用。3D模型可以描繪出藥物發(fā)揮作用的機(jī)理,然后虛擬其與靶標(biāo)(例如某種病毒)的互相作用。此后再進(jìn)行體外和體內(nèi)試驗(yàn)。

皮克馬爾解釋說:“截至目前,醫(yī)生們從自己的認(rèn)知出發(fā)進(jìn)行了一些試驗(yàn)。我們則基于物理學(xué)、信息技術(shù)或化學(xué)而進(jìn)行不同的研究。這種研究可以讓人們對病毒的認(rèn)知更進(jìn)一步,其結(jié)果也會與其他實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行分享。在新冠病毒問題上,存在著這樣一種風(fēng)險——盡管時間在推移,卻找不到任何有效的克制手段。這種情況過去在對艾滋病的研究上就出現(xiàn)過。目前艾滋病沒有任何疫苗,人們不得不依靠計(jì)算機(jī)的算力來研究預(yù)防性治療。”

如果進(jìn)行中的試驗(yàn)的最后結(jié)果令人失望,計(jì)算機(jī)也許能帶來新的治療理念。皮克馬爾進(jìn)一步解釋道:“一旦我們有了好的模型,就可以進(jìn)行虛擬篩選,也就是找到那些能與病毒相互作用的藥物成分。”但由于存在成千上萬種可能性,模擬過程可能會耗時很久,而且精確的結(jié)果也需要很大的運(yùn)算量和時間。

此外,算力也并不是獲得成功的保障。還應(yīng)當(dāng)考慮到數(shù)不清的物理規(guī)律。皮克馬爾表示:“在微觀層面,我們會看到水、離子以及高能電子區(qū)的相互作用……我們對物理的認(rèn)知仍有不少偏差。”



http://www.cankaoxiaoxi.com/science/20200427/2408689.shtml
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